http://biocomputing.cc/masatom/ 2010-07-30T16:51:56+09:00 http://biocomputing.cc/masatom/ http://biocomputing.cc/masatom/lib/images/favicon.ico text/html 2010-07-28T19:06:33+09:00 MASUYA Masato http://biocomputing.cc/masatom/mdbnch?rev=1280311593&do=diff MDBNCHを使って手もとのマシンのベンチマークを行った結果です。２つ以上のCPUを搭載しているマシンでも並列化は行っていませんのでCPU１個あたりの性能です． G5はIBMのコンパイラと組み合わせれば結構いける。Itanium2はIntelコンパイラでのみ性能発揮。gfortran/g77ではCore2 Duoが圧倒的。POWER5は高い割に大して速くない。ベストバイはCore2 Duo、次点はAthlon64の性能から類推するにOpteronか。amd64とSolaris 10とSunStudio 11の組み合わせはそこそこだがCore2 Duoには全然かなわない。… text/html 2010-07-01T18:23:42+09:00 MASUYA Masato http://biocomputing.cc/masatom/aboutj?rev=1277976222&do=diff [MASUYA Masato] 鹿児島大学 　学術情報基盤センター 　　情報システム開発部門 教授 　理学部 講師 　工学部 講師 　大学院理工学研究科 研究指導教員 　大学院医歯学総合研究科 講義担当教員 text/html 2010-06-16T14:44:51+09:00 MASUYA Masato http://biocomputing.cc/masatom/publicationsj?rev=1276667091&do=diff 学位論文 * 升屋正人, Mathematical Morphologyを用いたタンパク質分子の形状解析とリガンド-レセプター結合に関する研究, 東京大学大学院農学生命科学研究科博士学位論文, pp. 1-65, 1996. 査読付き論文(フルペーパー) * Masato Masuya and Junta Doi, “Detection and geometric modelling of molecular surfaces and cavities using mathematical morphological operations,” Journal of Molecular Graphics, vol. 13, pp. 331-336, 1995. (PubMed) * Masato Masuya and Junta Doi, “Extraction of Three-dimensional Multiple Skeletons and Digital Medial Skeleton,” IEICE Transactions on Information a…